De Vlaamse Hydrografische Atlas beschrijft de toestand van de geklasseerde waterlopen en van de publieke grachten en de wijze waarop ze beheerd worden.
De Vlaamse Milieumaatschappij (VMM) beheert de waterlopen van eerste categorie. In Hoogstraten betreft dit het deel van de Mark stroomafwaarts naar de monding van de Kleine Mark.
De watering is een openbaar bestuur dat als opdracht heeft binnen haar gebiedsomschrijving de waterhuishouding te beheersen.
In Hoogstraten is één watering werkzaam, met name de watering 'De Beneden Mark'.
Het beheer van de waterhuishouding gebeurt voornamelijk door een jaarlijkse ruiming van de belangrijke waterlopen en door het bouwen en onderhouden van sluizen en pompgemalen. De ingelanden (dit zijn de eigenaars van gronden, gelegen binnen de gebiedsomschrijving van de watering) worden jaarlijks belast. Deze belasting noemt men 'watergeschotten'.
De stad beheert de niet-geklasseerde grachten welke geheel of gedeeltelijk op openbaar domein zijn gelegen. Dit gebeurt door periodieke ruimingen en waar nodig door slib te ruimen. Ter hoogte van onbebouwde percelen wordt het geruimde materiaal op de oever gezet, ter hoogte van bebouwde percelen wordt dit afgevoerd.
Een inbuizing in een baangracht (overwelving) moet onderhouden worden door de aangelande eigenaar die hierdoor toegang krijgt tot zijn perceel.
Inbuizingen onder de rijweg worden beheerd door de wegbeheerder: voor gemeentewegen is dit het stadsbestuur, voor gewestwegen is dit AWV.
Grachten tussen private percelen en afwateringen van privaat terrein moeten door de aangelande eigenaar(s) onderhouden worden.
